Костел, посвященный святой Екатерине Александрийской, считается самой старой церковью в этой части города. Достоверно известно, что он существовал уже
в 1227 г., хотя некоторые исследователи считают, что первая церковь на этом месте была построена еще в 997 г., и в ней
святой Адальберт Пражский (Войцех) крестил жителей Старого города.
Свой современный вид костел приобрел, в основном, при перестройках XIV и XV вв; в частности, во второй половине XV в. была построена башня.
В 1575 г. на башне появились часы, а в 1634 г. был построен купол в стиле барокко — вероятно, по проекту Якоба ван ден Блока.
В 1905 г., после удара молнии, сгорели купол и башня, при этому был уничтожен карильон, установленный на башне в 1738 г. Через три года
башню восстановили. В 1945 г. церковь получила серьезные повреждения, вновь был разрушен купол. Восстановительные работы продолжались до
1987 г. Но 22 мая 2006 г. произошел новый пожар, в результате которого сгорела крыша костела, а башне грозило обрушение.
Лишь благодаря тому, что горящие обломки падали на бетонное перекрытие нефов, внутри костел пострадал только от воды.